拜仁慕尼黑的队徽历史悠久，自1900年以来，队徽曾经经历了6次变迁。
1900年，拜仁慕尼黑在创立之初，队徽就采用了当时流行的六角形标志，放置在蓝色背景上，并配以红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”，标志着拜仁慕尼黑的开始。
1906年，拜仁慕尼黑的队徽发生了第一次变迁，把原先的六角形标志换成了以牡蛎和鸽子为主体的标志，并用蓝色框框起来，其中红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”还是保留着。
1919年，拜仁慕尼黑的队徽再次发生变迁，这次变化更加显著，以牡蛎和鸽子为主体的标志被简化为一个由牡蛎和鸽子组成的“M”字标志，并用蓝色框框起来，其中红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”还是保留着。
1932年，拜仁慕尼黑的队徽发生了第三次变迁，采用了一个组合的象征标志，由一个蓝色的五角星和一个黄色的圆形组成，中间有一个“M”字，其中红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”还是保留着。
1953年，拜仁慕尼黑的队徽发生了第四次变迁，把原有的象征标志简化为一个红色的五角星，中间仍有一个“M”字，其中红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”还是保留着。
1969年，拜仁慕尼黑的队徽又发生了第五次变迁，把原有的红色五角星改成了白色，中间依然有一个“M”字，其中红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”还是保留着。
2002年，拜仁慕尼黑的队徽发生了最后一次变迁，把原有的白色五角星改成了绿色，中间仍有一个“M”字，其中红色字体“FC BAYERN MUNCHEN”还是保留着。至此，拜仁慕尼黑的队徽经历了6次变迁，现在的队徽已经深入人心，在全球范围内广受欢迎。
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